V první polovině 70. let 23. století monitorovací stanice Hvězdné flotily hlásí nepřátelskou sílu skrytou v obrovském energetickém oblaku, který cestou k Zemi zničí tři klingonské válečné lodě i samotnou stanici. Hvězdná loď Enterprise nyní prochází opravou a modernizací. Protože v okolí není žádná jiná loď, tak Flotila vyšle k blížícímu se objektu Enterprise. Kirk převezme velení a jejího velícího důstojníka, kapitána Willarda Deckera, dočasně degraduje na prvního důstojníka. Testování nových lodních systémů nedopadne dobře, neboť při přesunu na loď zemřou vinou selhání transportéru dva důstojníci. Rovněž nesprávně seřízené motory skoro zničí celou loď. Napětí mezi Kirkem a Deckerem vzrůstá. K posádce se cestou k vetřelci přidá i Spock, jenž převezme místo vědeckého důstojníka. Loď je po vlétnutí do oblaku napadena neznámým vetřelcem. Jeho sonda pronikne do lodi a při průzkumu počítačů zaútočí na Spocka a unese navigátora Iliu. Spock ve skafandru s tryskovým pohonem opustí loď a snaží se nepřátelské plavidlo prozkoumat...
